时间:2022-06-30 09:37 来源:鏈煡 作者:绠$悊鍛 点击:次
近日,深圳大学高等研究院教授李孟研究小组在国际期刊上《Microbiome》2019年影响因素:10.中科院一区465发表题为Genomic and transcriptomic evidence of light-sensing,porphyrin biosynthesis,Calvin-Benson-Bassham cycle,and urea production in Bathyarchaeota研究论文。本文结合基因组和转录组,深入探讨了以前未发现的深古菌(Bathyarchaeota)新陈代谢潜力:光敏感性、啉产生、开尔文循环和尿素产生。深圳大学高等研究所教授李孟是论文通信的作者,团队成员、副研究员潘杰是第一作者。该工作由深圳大学、香港大学和以色列理工学院共同完成。该研究得到了国家自然科学基金会、深圳科技创新委员会和广东省教育部的支持。
深古菌是一种新发现的古菌类别,被普遍认为是全球碳循环的重要驱动因素之一。然而,由于深古菌的物种多样性很大,有限的基因组数据和分析研究结果并没有全面阐述这一新古菌类别的代谢机制和环境效应。
本研究从深圳福田红树林沉积物的宏基因组中建立了多个深古菌基因组,分为四个深古菌亚类。结合对比基因组学和宏转录组学的分析,深古菌不仅可能具有光营养和自营养的营养方法,而且在全球氮和硫循环中发挥重要作用。值得一提的是,在深古菌中更独特的亚类-亚类6(Bathyarchaeota subgroup 6)的基因组中,发现了独特的视紫红素、维生素B12合成和耗氧代谢的相关基因和代谢路径表明,深古菌亚类6具有易于其他亚类的潜在光敏微耗氧生活方式。
这一系列研究结果不仅拓展了人们对于深古菌生理生化代谢能力和生活方式的了解,也使人们更加重视深古菌在全球各元素循环中所扮演的角色。(贾孟杰)
责编:张阳
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